Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB1P20700 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNB1P20700 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms