Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD53P19397 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD53P19397 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD53P19397 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD53P19397 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD53P19397 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms