Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCLP19338 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCLP19338 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCLP19338 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCLP19338 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCLP19338 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCLP19338 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCLP19338 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCLP19338 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCLP19338 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCLP19338 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCLP19338 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCLP19338 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCLP19338 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCLP19338 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCLP19338 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCLP19338 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCLP19338 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCLP19338 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCLP19338 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCLP19338 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms