Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL17P18621 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL17P18621 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL17P18621 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL17P18621 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL17P18621 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL17P18621 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL17P18621 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL17P18621 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL17P18621 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms