Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRAP18433 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRAP18433 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
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