Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN1P18031 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN1P18031 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms