Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPI1P17947 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPI1P17947 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPI1P17947 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms