Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYN1P17600 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYN1P17600 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYN1P17600 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYN1P17600 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYN1P17600 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYN1P17600 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYN1P17600 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYN1P17600 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYN1P17600 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYN1P17600 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYN1P17600 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYN1P17600 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYN1P17600 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYN1P17600 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms