Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2A2P16615 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms