Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSPP15924 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSPP15924 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSPP15924 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSPP15924 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSPP15924 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSPP15924 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSPP15924 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSPP15924 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSPP15924 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSPP15924 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSPP15924 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSPP15924 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSPP15924 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSPP15924 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms