Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC130P13994 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC130P13994 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms