Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF35P13682 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms