Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms