Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms