Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT3P12035 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT3P12035 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT3P12035 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT3P12035 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT3P12035 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT3P12035 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT3P12035 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT3P12035 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT3P12035 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT3P12035 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT3P12035 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT3P12035 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT3P12035 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT3P12035 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT3P12035 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT3P12035 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms