Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms