Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP1P11387 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1P11387 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1P11387 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1P11387 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1P11387 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1P11387 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1P11387 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1P11387 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1P11387 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1P11387 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1P11387 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1P11387 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP1P11387 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOP1P11387 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOP1P11387 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOP1P11387 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOP1P11387 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOP1P11387 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOP1P11387 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1P11387 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1P11387 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1P11387 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1P11387 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP1P11387 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP1P11387 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOP1P11387 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP1P11387 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms