Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PF4V1P10720 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms