Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ87

DUX4L4, Double homeobox protein 4-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L4P0CJ87 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L4P0CJ87 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L4P0CJ87 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms