Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA3P0C7M3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms