Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP10P09238 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP10P09238 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP10P09238 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP10P09238 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP10P09238 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP10P09238 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP10P09238 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP10P09238 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP10P09238 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP10P09238 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP10P09238 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP10P09238 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP10P09238 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP10P09238 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP10P09238 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP10P09238 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP10P09238 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP10P09238 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP10P09238 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP10P09238 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP10P09238 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP10P09238 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP10P09238 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP10P09238 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP10P09238 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP10P09238 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP10P09238 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms