Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms