Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSLP07711 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTSLP07711 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTSLP07711 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTSLP07711 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTSLP07711 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSLP07711 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSLP07711 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSLP07711 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTSLP07711 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms