Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRBV12-3P01733 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms