Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-5P01602 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms