Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOSP01100 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSP01100 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSP01100 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSP01100 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSP01100 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSP01100 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSP01100 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSP01100 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOSP01100 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOSP01100 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOSP01100 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOSP01100 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOSP01100 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOSP01100 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms