Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINC1P01008 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINC1P01008 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms