Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSD2O96028 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD2O96028 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD2O96028 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD2O96028 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD2O96028 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD2O96028 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD2O96028 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD2O96028 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD2O96028 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD2O96028 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD2O96028 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD2O96028 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD2O96028 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSD2O96028 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD2O96028 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD2O96028 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD2O96028 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSD2O96028 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSD2O96028 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD2O96028 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSD2O96028 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSD2O96028 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD2O96028 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSD2O96028 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD2O96028 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NSD2O96028 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NSD2O96028 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NSD2O96028 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NSD2O96028 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NSD2O96028 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NSD2O96028 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NSD2O96028 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NSD2O96028 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NSD2O96028 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NSD2O96028 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NSD2O96028 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NSD2O96028 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NSD2O96028 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NSD2O96028 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NSD2O96028 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NSD2O96028 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NSD2O96028 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSD2O96028 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NSD2O96028 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NSD2O96028 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NSD2O96028 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NSD2O96028 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NSD2O96028 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NSD2O96028 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NSD2O96028 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NSD2O96028 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms