Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN7O95471 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN7O95471 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms