Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM2O94769 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM2O94769 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM2O94769 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM2O94769 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM2O94769 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM2O94769 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM2O94769 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM2O94769 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM2O94769 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM2O94769 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM2O94769 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM2O94769 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM2O94769 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM2O94769 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM2O94769 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM2O94769 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM2O94769 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM2O94769 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM2O94769 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM2O94769 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM2O94769 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM2O94769 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM2O94769 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM2O94769 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM2O94769 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM2O94769 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM2O94769 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM2O94769 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM2O94769 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM2O94769 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM2O94769 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM2O94769 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM2O94769 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM2O94769 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM2O94769 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms