Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
BBOX1O75936 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms