Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF40AO75400 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms