Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF40O75150 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF40O75150 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF40O75150 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF40O75150 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF40O75150 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF40O75150 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF40O75150 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF40O75150 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF40O75150 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF40O75150 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms