Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms