Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSNA1O43805 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSNA1O43805 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms