Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGTAO43765 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGTAO43765 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGTAO43765 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGTAO43765 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGTAO43765 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGTAO43765 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGTAO43765 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGTAO43765 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGTAO43765 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGTAO43765 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGTAO43765 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGTAO43765 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGTAO43765 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGTAO43765 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGTAO43765 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGTAO43765 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGTAO43765 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms