Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GATCO43716 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GATCO43716 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GATCO43716 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GATCO43716 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GATCO43716 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GATCO43716 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GATCO43716 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GATCO43716 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GATCO43716 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GATCO43716 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GATCO43716 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms