Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN2DO15399 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms