Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARPC1BO15143 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms