Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC27A2O14975 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A2O14975 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms