Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLGNO14967 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLGNO14967 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLGNO14967 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLGNO14967 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLGNO14967 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLGNO14967 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLGNO14967 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLGNO14967 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLGNO14967 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLGNO14967 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLGNO14967 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms