Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC01387J3KSC0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01387J3KSC0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms