Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PROB1E7EW31 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms