Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRBOX1C9JBD0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRBOX1C9JBD0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRBOX1C9JBD0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRBOX1C9JBD0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRBOX1C9JBD0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRBOX1C9JBD0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRBOX1C9JBD0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRBOX1C9JBD0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRBOX1C9JBD0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRBOX1C9JBD0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRBOX1C9JBD0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRBOX1C9JBD0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms