Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRDCB7Z8K6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRDCB7Z8K6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms