Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B4DEV8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
B4DEV8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B4DEV8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DEV8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms