Protein–RNA interactions for Protein: A8MYZ0

MINDY4B, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4B, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4BA8MYZ0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MINDY4BA8MYZ0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MINDY4BA8MYZ0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MINDY4BA8MYZ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MINDY4BA8MYZ0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms