Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSPB2A8KAH6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSPB2A8KAH6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms