Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YJEFN3A6XGL0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YJEFN3A6XGL0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms