Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL13PA6NNM8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms